Spoluzakladateľ a dlhoročný generálny riaditeľ Esetu, najväčšej IT firmy v slovenskom vlastníctve. V Esete má najvyšší podiel (22,75 percenta), v rebríčku je tak zo šestice „eseťákov“ prvý. Rok 2021 uzavrel Eset s konsolidovanými tržbami 550 miliónov eur, konsolidovaný čistý zisk dosiahol 69 miliónov eur. Majetok spoločníkov Esetu pochádza v drvivej väčšine z firmy, a to v zásade z dvoch zdrojov: prvým je ocenenie trhovej hodnoty firmy, ktoré je vďaka jej moderným produktom a technológiám dostupným na globálnom trhu násobne vyššie ako u tradičných, povedzme strojárskych či potravinárskych odvetví.
Druhým zdrojom je spomínaný čistý zisk – ten Eset od roku 2009 každoročne generuje v rozmedzí zhruba od 50 do 70 miliónov eur, z čoho si majitelia pravidelne vyplácajú významnú časť v podobe dividend.
Pred desaťročím začal Trnka okrem Esetu podnikať aj v nehnuteľnostiach: v rodnej Trnave postupne zrekonštruoval viaceré budovy historického centra. V Bratislave obnovil budovu študentského centra Binarium v Mlynskej doline, v prestížnej lokalite pod Slavínom sa stal majiteľom Rotundy. Na chorvátskom pobreží si pred rokmi kúpil veľké sídlo, keďže medzi jeho záľuby patrí (popri zbieraní zosilňovačov) aj jachtárstvo. Rodinnú firmu Trnka Gastronomy s tromi podnikmi v Trnave a jedným v Bratislave vlastní syn Michal. V Trnka Investments si otec drží väčšinu, Michal a aj Trnkova dcéra Petra sú s ním konateľmi. Z investícií do startupov mu najviac vyšlo Photoneo v oblasti next gen 3D robotiky, „ítéčkarov“ z firiem Citadelo a Nethemba zasa podporil v projekte etického hekovania HackTrophy.
Najvýraznejším Trnkovým projektom mimo realít je od roku 2014 nadácia Zastavme korupciu. V posledných rokoch ju podporoval ročne sumou približne štvrť milióna eur. Dlhodobo tiež pôsobí v Nadácii Eset, ktorá do roku 2021 kumulovane vykázala podporu projektov za 3,4 milióna eur, tento rok pridala 700-tisíc pre občanov Ukrajiny. Rovnako ako ostatní spolumajitelia Esetu, aj Trnka podporil pred rokmi štart Denníka N. Prispel aj na kampaň neskoršieho bratislavského primátora Matúša Valla.